La victoire des Francs sur les Alamans en 496 leur permet de s'installer dans certaines régions, où ils occupent des fonctions de commandement. Mais l'empreinte des Alamans est très marquée en Alsace et se traduit notamment par l'adoption de leur langue, dont le dialecte alsacien est issu.

En 496 Clovis est contraint à une campagne contre les Alamans, qui jouxtent la frontière Est des nouveaux territoires saliens. Après avoir invoqué en vain ses dieux païens, il implore avec succès le Dieu de Clothilde ; cette victoire miraculeuse le poussera à se convertir au catholicisme.

Au cours de son règne, Clovis conquiert peu à peu tous les territoires de l'ancienne Gaule. Leur royaume ne sera complètement reconstitué qu'en 524, sous le règne de son fils Clodomir.

Il défait les derniers Gallo-Romains, met un terme au royaume de Syagrius lors de la bataille de Soissons et bat les Burgondes à Ouche. Il repousse également les Alamans et les Wisigoths, tandis que les Francs atteignent les Pyrénées. Selon la coutume des Francs, le royaume de Clovis est partagé entre ses quatre fils à sa mort. Les nombreuses guerres de succession affaiblissent le royaume franc et la dynastie mérovingienne va finir par se faire voler la réalité du pouvoir par les maires du palais : ce sera l'époque des rois fainéants.